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COVID-19防疫專線於109年2月23日正式啟用，歷經3年多的日子，共計42萬6962通進線量，防疫專線人員不分晝夜及假日，24小時守護著市民，提供疫情問題之單一諮詢窗口，終於要隨著疫情的趨緩於5月底畫下句點。

衛生福利部疾管署署長莊人祥今(18)日特地南下慰勉台南市府各局處人員的動員與合作，台南市長黃偉哲也致詞特別感謝防疫專線人員、專責醫院於疫情期間無私的貢獻與付出，努力攜手維護台南市民平安。新冠肺炎自5月1日自第5類法定傳染病改為第4類，中央流行疫情指揮中心也同步解編，台南市防疫專線將於5月底功成身退，完成階段性任務。 

台南市衛生局表示，疫情期間人心惶惶，3年多來防疫專線人員24小時排解市民各類疑難問題，包含隔離檢疫、就醫採檢、居隔單、快篩領取、疫苗接種等防疫諮詢。疫情初期，防疫專線需協助居家檢疫民眾奔喪與探親之安排，某位長期旅居國外之民眾，因母親病重而匆匆返台探親，返台後透過防疫專線安排採檢、防疫計程車接送及聯繫醫院探視等事宜，最後，終於順利見到母親最後一面，後續民眾也致電感謝專線人員的安排與協助，防疫專線不只是接聽電話，而是協助市民朋友解決防疫問題的好夥伴。

台南市衛生局補充，防疫專線設置亦隨著疫情與政策變化做滾動式修正，111年4月一天進線數曾高達4,000多通，也增設它線生活關懷專線因應市民諮詢，降低市民疫情期間的恐懼和不安。